Ki se nanašajo na več kot 100 antigenov na površini celic tkiva človeškega telesa, ki lahko prepozna nekatere vrste levkocitov in potencialno vodi do zavrnitve teh tkiv, če so tujec. The HLA sistem je večina genov od vseh drugih znanih ljudi več alel serije. So vsaj 30,000,000 možno HLA genotipov. Kadar presaditev ne uspe, je ponavadi zaradi nezdružljivosti HLA. To je treba preprečiti, da se prepriča, da je dajalec in prejemnik imajo enake ali zelo podobne vrste HLA. Imunosupresivnih zdravil tudi so zdaj na voljo za omejevanje HLA sistem in s tem omogočajo uspešno presaditev, ko gre za HLA nezdružljivost med darovalcem in prejemnikom. HLA stojala za "človeških levkocitov antigena".