Primitívne (bližšie nešpecifikovaný) bunky, ktoré majú potenciál stať sa širokú škálu typov špecializovaných buniek (t. j. srdcové myocytů, nervových buniek, pankreasu). Sú pluripotentných bunky pochádzajúce z vnútornej buniek hmotnosti blastocysty. Embryonálne kmeňové bunky nie sú embryá a nemôže stať kompletný organizmu.