Het aandeel van de gameten die zijn ontstaan uit recombinatie tussen twee loci. Geschat wordt als het aantal recombinante individuen onder een aantal nakomelingen van een bepaalde paring, gedeeld door het totale aantal nakomelingen van dat paring. Vertegenwoordigd door de Griekse letter theta (). Koppeling kaarten worden gemaakt van ramingen van recombinatie breuk tussen alle paarsgewijse combinaties van loci.