Een klasse van enzymen die degraderen van DNA of RNA molecules door splijten van de phospho-diester obligaties die link aangrenzende nucleotiden. In deoxyribonuclease (DNase), het substraat is DNA. In endonuclease, het cleaves op interne sites in het substraat molecuul. Exonuclease cleaves geleidelijk vanaf het einde van het substraat molecuul. In ribonuclease (RNase), is het substraat RNA. In de S1 nuclease, het substraat is single-stranded DNA of RNA. Nucleasen hebben wisselend base-sequence specificiteit, de meest specifieke wordt de beperkingsendonucleases.