זיהום שנגרם על-ידי מספר מינים של microsporidia הטפיל protozoan. Microsporidia בדרך כלל להדביק את מערכת העיכול, אך עלולה גם לפגוע בחלקים אחרים של הגוף, כגון עיניים, במערכת הנשימה או המוח. הסימפטומים הנפוצים ביותר שלשול כרוני, לבזבז, אך התסמינים משתנים מאוד האתר של זיהום. Microsporidiosis מתרחשת בעיקר אצל אנשים עם מערכות החיסון חלשה, במיוחד אנשים עם HIV או אנשים שעברו השתלות איברים.