Il metodo iniziale della transgenesi negli animali, che coinvolge iniettare molte copie di un gene particolare in uno dei due pro-nuclei di un ovuli fecondati. Caratterizzato da un tasso di successo molto basso. Come clonazione (q.v.) animale diventa più comune, pro-nucleare micro-iniezione sarà sostituito da micro-iniezione di geni clonati in una coltura di embrioni clonati, prodotto da trasferimento nucleare, che può essere testato per l'espressione del transgene prima del trasferimento al destinatario femmine.