Un mapa de la ubicación de señales identificables en ADN (por ejemplo, sitios de corte de enzimas de restricción, los genes), independientemente de la herencia. Distancia se mide en pares de bases. Para el genoma humano, el mapa físico de menor resolución es los patrones de bandas en los 24 cromosomas diferentes; el mapa de mayor resolución es la secuencia nucleotídica completa de los cromosomas.