Μια ασθένεια του ανοσοποιητικού συστήματος οφείλεται απευθείας σε μόλυνση με τον ιό HIV. HIV καταστρέφει το λεμφοκύτταρα CD4 T (κύτταρα CD4) του ανοσοποιητικού συστήματος, αφήνοντας τον οργανισμό ευάλωτες στις λοιμώξεις και καρκίνου απειλητική για τη ζωή. Σύνδρομο της επίκτητης ανοσολογικής ανεπάρκειας (AIDS) είναι το πιο προηγμένο στάδιο της μόλυνσης από τον HIV.