Το μοναδικό σχήμα των αποκομμένων τμημάτων DNA αρχικά προσδιορίζονται από Νότια υβριδοποίησης (με χρήση ενός καθετήρα που συνδέει ένα πολυμορφικοί περιοχή του DNA) ή τώρα από την αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης (PCR) (χρησιμοποιώντας αστάρια συνοδευτικών πολυμορφικοί περιοχή).