Ein Enzym, das DNA oder RNA, die an den Enden der Stränge verdaut. Es ein freies Ende erfordert, um ein DNA oder RNA-Molekül zu beeinträchtigen. 5´ Exonucleases erfordern eine kostenlose 5´-Ende und beeinträchtigen das Molekül in der 5´ in 3´ Richtung. 3´ Exonucleases erfordern eine kostenlose 3´-Ende und beeinträchtigen das Molekül in die entgegengesetzte Richtung.