تسلسل النوكليوتيدات محددة في الحمض النووي يتم التعرف عليه بواسطة endonuclease قيد الثاني نوع وداخل مما يجعل قطع مزدوجة-الذين تقطعت بهم السبل. تقييد مواقع عادة ما تضم أربعة أو ستة من الأزواج الأساسية التي هي عادة المتناوب (q.v.)،

مثلاً، 5´GGCC3´

3´CCGG5´

شقين قد يكون قطع أما مقابل بعضها البعض، لإنشاء نهايات حادة، أو بطريقة متعاقبة، إعطاء لزجة ينتهي، تبعاً لأنزيم المعنية.